Informace o projektu
Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii
- Kód projektu
- MSM 143300002
- Období řešení
- 1/1999 - 12/2004
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Výzkumné záměry
- Fakulta / Pracoviště MU
- Fakulta informatiky
- Klíčová slova
- image analysis; image processing; segmentation; preprocessing; deconvolution; 3D analysis; 3D reconstruction; mathematical morphology; parallel computing; parallel algorithms; optical microscopy; confocal microscopy; automation; automated microscopy
Cíl: Cílem projektu je výzkum v oblasti počítačové analýzy mikroskopického obrazu, v oblasti automatizace procesu snímání a on-line analýzy obrazu a aplikace získaných poznatků v praxi. Návrh předpokládá jak pokračování v běžícím výzkumu struktury buněčného jádra s klinickým uplatněním při diagnostice a prevenci leukémií a jiných nádorových onemocnění, tak rozšíření výzkumu na jiné aplikace počítačové analýzy mikroskopického obrazu, biomedicínské i průmyslové. Obsah: Zkoumány budou zejména algoritmy předzpracování a segmentace obrazu s důrazem na dekonvoluci 3D obrazu, na operace matematické morfologie a na 3D rekonstrukci obrazu ze série 2D obrazových řezů. Intenzivní výzkum bude veden také v oblasti paralelních algoritmů analýzy obrazu a paralelizace vybraných algoritmů na víceprocesorových pracovních stanicích s využitím vybavení Superpočítačového centra MU.Vzhledem ke značné interdisciplinárnosti,bude udržována těsná spolupráce s kolegy ze špičkových pracovišť v Oxfordu,Heidelbergu a dalších míst.
Výsledky
Cílem projektu je výzkum v oblasti počítačové analýzy mikroskopického obrazu, v oblasti automatizace procesu snímání a on-line analýzy obrazu a aplikace získaných poznatků v praxi.
Publikace
Počet publikací: 88
2004
-
Towards a Fully Automated Tissue Cell Segmentation Method
Visualization, Imaging, and Image Processing, rok: 2004
2003
-
3D Object reconstructions in image cytometry
Biophysics of the Genome, rok: 2003
-
A network solution for high-resolution image cytometry
Biophysics of the Genome, rok: 2003
-
Analysis of DNA methylation status of cell nuclei using high-resolution
Biophysics of the Genome, rok: 2003
-
Architecture of chromosomal territories in apoptotic cells
Biophysics of the Genome, rok: 2003
-
Arrangement of chromosome 11 and 22 territories, EWSR1 and FLI-1 genes, and other genetic elements of these chromosomes in human lymphocytes and Ewing sarcoma cells
Human Genetics, rok: 2003, ročník: 112, vydání: 2
-
Cytogenetics and cytology of retinoblastomas
J Cancer Res. Clin.Oncol., rok: 2003, ročník: 129, vydání: 2
-
Chromosomal territory segmentation in apoptotic cells
Cellular and Molecular Life Sciences, rok: 2003, ročník: 60, vydání: 5
-
Improving measurement precision using automated micro-axial tomography
Biophysics of the Genome, rok: 2003
-
Multilevel Adaptive Thresholding and Dual Simplex Mesh Deformation as a Tool for Tissue Reconstruction
Visualization, Imaging, and Image Processing, rok: 2003