Informace o projektu
Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii
- Kód projektu
- MSM 143300002
- Období řešení
- 1/1999 - 12/2004
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Výzkumné záměry
- Fakulta / Pracoviště MU
- Fakulta informatiky
- Klíčová slova
- image analysis; image processing; segmentation; preprocessing; deconvolution; 3D analysis; 3D reconstruction; mathematical morphology; parallel computing; parallel algorithms; optical microscopy; confocal microscopy; automation; automated microscopy
Cíl: Cílem projektu je výzkum v oblasti počítačové analýzy mikroskopického obrazu, v oblasti automatizace procesu snímání a on-line analýzy obrazu a aplikace získaných poznatků v praxi. Návrh předpokládá jak pokračování v běžícím výzkumu struktury buněčného jádra s klinickým uplatněním při diagnostice a prevenci leukémií a jiných nádorových onemocnění, tak rozšíření výzkumu na jiné aplikace počítačové analýzy mikroskopického obrazu, biomedicínské i průmyslové. Obsah: Zkoumány budou zejména algoritmy předzpracování a segmentace obrazu s důrazem na dekonvoluci 3D obrazu, na operace matematické morfologie a na 3D rekonstrukci obrazu ze série 2D obrazových řezů. Intenzivní výzkum bude veden také v oblasti paralelních algoritmů analýzy obrazu a paralelizace vybraných algoritmů na víceprocesorových pracovních stanicích s využitím vybavení Superpočítačového centra MU.Vzhledem ke značné interdisciplinárnosti,bude udržována těsná spolupráce s kolegy ze špičkových pracovišť v Oxfordu,Heidelbergu a dalších míst.
Výsledky
Cílem projektu je výzkum v oblasti počítačové analýzy mikroskopického obrazu, v oblasti automatizace procesu snímání a on-line analýzy obrazu a aplikace získaných poznatků v praxi.
Publikace
Počet publikací: 88
2006
-
Localization of genetic elements of intact and derivative chromosome 11 and 22 territories in nuclei of Ewing sarcoma cells
Journal of Structural Biology, rok: 2006, ročník: 155, vydání: 3
2005
-
Image acquisition and its automation in fluorescence microscopy
From cells to proteins: Imaging nature across dimensions, rok: 2005, počet stran: 44 s.
-
Segmentace buněk v biomedicínském obraze pomocí genetických algoritmů
Kognícia a umelý život V., rok: 2005
2004
-
Applications of Image Registration in Human Genome Research
Computer Vision and Mathematical Methods in Medical and Biomedical Image Analysis, rok: 2004
-
Automated acquisition and processing of multidimensional image data in confocal in vivo microscopy
Microscopy research and technique, rok: 2004, ročník: 64, vydání: 2
-
Automated confocal microscopy: The way of achieving both quality and quantity in 3D image cytometry
International Symposium on Biomedical Imaging, rok: 2004
-
Automated confocal microscopy: The way of achieving both quality and quantity in 3D image cytometry
Rok: 2004, druh: Vyžádané přednášky
-
Automated image analysis in fluorescence microscopy: From isolated cells to tissues and microarray images
Biophysics of the Genome, rok: 2004
-
Automated in vivo imaging of cell interior using fluorescent proteins
Rok: 2004, druh: Konferenční abstrakty
-
Biophysics of the Genome
Rok: 2004, druh: Uspořádání workshopu