Informace o projektu
Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii
- Kód projektu
- MSM 143300002
- Období řešení
- 1/1999 - 12/2004
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Výzkumné záměry
- Fakulta / Pracoviště MU
- Fakulta informatiky
- Klíčová slova
- image analysis; image processing; segmentation; preprocessing; deconvolution; 3D analysis; 3D reconstruction; mathematical morphology; parallel computing; parallel algorithms; optical microscopy; confocal microscopy; automation; automated microscopy
Cíl: Cílem projektu je výzkum v oblasti počítačové analýzy mikroskopického obrazu, v oblasti automatizace procesu snímání a on-line analýzy obrazu a aplikace získaných poznatků v praxi. Návrh předpokládá jak pokračování v běžícím výzkumu struktury buněčného jádra s klinickým uplatněním při diagnostice a prevenci leukémií a jiných nádorových onemocnění, tak rozšíření výzkumu na jiné aplikace počítačové analýzy mikroskopického obrazu, biomedicínské i průmyslové. Obsah: Zkoumány budou zejména algoritmy předzpracování a segmentace obrazu s důrazem na dekonvoluci 3D obrazu, na operace matematické morfologie a na 3D rekonstrukci obrazu ze série 2D obrazových řezů. Intenzivní výzkum bude veden také v oblasti paralelních algoritmů analýzy obrazu a paralelizace vybraných algoritmů na víceprocesorových pracovních stanicích s využitím vybavení Superpočítačového centra MU.Vzhledem ke značné interdisciplinárnosti,bude udržována těsná spolupráce s kolegy ze špičkových pracovišť v Oxfordu,Heidelbergu a dalších míst.
Výsledky
Cílem projektu je výzkum v oblasti počítačové analýzy mikroskopického obrazu, v oblasti automatizace procesu snímání a on-line analýzy obrazu a aplikace získaných poznatků v praxi.
Publikace
Počet publikací: 88
2003
-
Nuclear and territorial topography of chromosome telomeres in human lymphocytes
Experimental Cell Research, rok: 2003, ročník: 289, vydání: 1
-
Počítačové zpracování 2D a 3D obrazů buněk, buněčných jader, chromosomů a genů pomocí automatizované optické mikroskopie
Rok: 2003, druh: Vyžádané přednášky
-
Precise 3D image alignment in micro-axial tomography
Journal of Microscopy, rok: 2003, ročník: 209, vydání: 2
-
Spherical Object Reconstruction Using Simplex Meshes from Sparse Data
Discrete Geometry for Computer Imagery, rok: 2003
-
Structural and functional characterization of uncoupling proteins: Alkylsulfonates as probes of UCP transport mechanism
Biophysics of the Genome, rok: 2003
-
Study of the gene expression in malignant diseases by cDNA microarray technology
Biophysics of the Genome, rok: 2003
-
Tissue image reconstruction: Localization of nuclei markers and segmentation based on deformable models
Biophysics of the Genome, rok: 2003
-
Tissue Reconstruction Based on Deformation of Dual Simplex Meshes
Discrete Geometry for Computer Imagery, rok: 2003
-
Topography of telomeres and structure of chromosome territories in human lymphocytes
Biophysics of the Genome, rok: 2003
2002
-
3D Structure of the human genome: Order in randomness
Chromosoma, rok: 2002, ročník: 111, vydání: 5